La dotazione di Horizon Europe è pari a 95,5 miliardi di euro (in prezzi correnti), di cui 90,1 provenienti dal tradizionale bilancio comune e 5,4 dal PianHORIZON EUROPE BUDGETo per la ripresa dell'Europa (Next Generation EU).

Più della metà del budget (56%, pari a circa 53.5 miliardi di euro) è destinato al secondo pilastro - Global Challenges and European Industrial Competitiveness. A seguire il primo pilastro - Excellent Science (26%, pari a circa 25 miliardi di euro) e il terzo pilastro - Innovative Europe (14%, pari a circa 13.5 miliardi di euro). Infine l'azione trasversale - Widening participation and strengthening the European Research Area, a cui viene assegnato poco meno del 4% del budget, pari a circa 3 miliardi di euro.

Complessivamente, i sei cluster di Horizon Europe assorbono circa il 54% delle risorse del Programma e, in linea con le priorità della Commissione europea, al cluster 4 (Digital, Industry and Space) e 5 (Climate, Energy and Mobility) vengono assegnati rispettivamente 15.3 e 15.1 miliardi di euro. A seguire il cluster 1 (Health) con 8.2 miliardi di euro. In generale, la singola linea di finanziamento che complessivamente assorbe più risorse è l'ERC: il Consiglio europeo della ricerca con circa il 16,75% ha infatti un budget pari a circa 16 miliardi di euro. All'European Innovation Council vengono invece destinati circa 10 miliardi di euro, pari al 10,5% del budget complessivo.

Di seguito il dettaglio completo del budget:

Horizon EuropeMisuraMiliardi di €% sul totale
Pillar IERC16,00416,75%
MSCA6,6036,91%
Research infrastructures2,4062,52%
Pillar IICluster 18,2468,63%
Cluster 22,2812,39%
Cluster 31,5971,67%
Cluster 415,34816,07%
Cluster 515,12315,83%
Cluster 68,9529,37%
JRC1,972,06%
Pillar IIIEIC10,10510,58%
Innovation Ecosystems0,5280,55%
EIT2,9663,11%
Widening participation and strengthening the ERAWidening participation and spreading excellence2,9553,09%
Reforming and enhancing the European R&I system0,4380,46%
  95,522100,00%