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Uno dei rischi più seri per gli ecosistemi marini e di acqua dolce, e conseguentemente per la salute umana, deriva dagli agenti inquinanti e patogeni, specialmente i batteri resistenti antibiotici, nell'ambiente.
Per affrontare questa sfida e fornire soluzioni multidisciplinari al fine di ottenere un ecosistema acquatico pulito, tre iniziative di programmazione congiunta, "Water Challenges for a Changing World" della Water JPI, "Healthy and Productive Seas and Oceans" della JPI Oceans e "On Antimicrobial Resistance" della JPI AMR stanno agendo per rafforzare l'Area di Ricerca Europea nel settore di riferimento. Nel 2020 lanceranno inoltre un bando transnazionale multidisciplinare e co-finanziato per proposte in ricerca e innovazione.
Le tre iniziative, insieme al Consiglio di Ricerca svedese, e Formas, stanno riunendo esperti per discutere il problema degli agenti patogeni e inquinanti durante la World Water Week a Stoccolma, l'evento annuale che affronta la tematica dell'acqua su scala globale. Quest'anno il tema sarà "acqua, ecosistemi e sviluppo umano".